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Relative Biological Effectiveness (RBE) 어제 방사선량에 대한 글을 적으면서 생물학적인 효과에 대해 (아주) 살짝 언급 했었는데, 때마침 한국의학물리 학회지에 Carbon ion beam therapy RBE에 관한 리뷰가 실렸다. 내용이 길지 않고 간단 명료해서 학생들이 시작점으로 삼기에 좋을 것 같다. 게다가 Open access 라는. http://www.progmedphys.org/journal/view.html?spage=1&volume=31&number=1 Review of the Existing Relative Biological Effectiveness Models for Carbon Ion Beam Therapy Yejin Kim , Jinsung Kim , Seungryong Cho. Progress in Medical Phy.. 2020. 4. 23.
방사선량과 에너지 방사선량 radiation dose은 줄여서 선량 dose이라고 이야기 하기도 합니다. 국제단위계 SI에서는 선량의 단위로 Gy 를 사용합니다. 요즘은 모두들 이 SI 단위인 Gy 또는 cGy (1 cGy = 0.01 Gy) 단위를 임상에서 사용하고 있는데요, 옛날에는 rad (1 rad = 1 cGy) 라는 단위를 많이들 사용했다고 합니다. 개인적으로는 (왜때문인지는 기억이 잘 나지 않지만...) 오래된 기록들을 뒤지다가 rad로 처방이 되어있는 것을 딱 한 번 본 적이 있습니다. 아무튼 이 Gy는 기본단위는 아니고 유도단위로써 J/kg으로 나타낼 수 있습니다. 즉, 주어진 물질의 단위 질량(kg) 당 흡수된 에너지(J)로 이해할 수 있는 것이지요. 그렇다면, 여기서 우리는 질문을 하나 해 볼 수 있습.. 2020. 4. 22.
TOPAS version 3.3 release 2020년 3월 25일(미국시간 기준이겠지?)부로 TOPAS version 3.3이 배포되었다. 주말에 3.2 patch2 설치를 했었는데... 내 이럴 줄 알았나... 얼마 전 부터 beta version으로 지원이 되던 Qt GUI를 포함한 정식 release라서 바로 설치하고 테스트를 해보았다: 늘 하던대로 환경 변수들을 설정하는 shell script를 실행하였는데도 topas 실행 파일을 못찾길래, 자세히 보니 새로이 bin directory를 만들고 거기에 topas 실행 파일을 넣어 두었네 - 사실 이게 더 친숙한 구조. Script를 간단히 수정해 주고, 바로 Qt test를 실행해본다. 마우스로 회전 시키면서 살펴 볼 수도 있고 직접 실행도 해 볼 수 있으니, 이제 따로 HepRep vi.. 2020. 3. 26.
Sourcing vs. Executing a file in bash bash shell에서 파일을 실행할 때 별 생각없이 두 가지 방법들('source file.sh' 그리고 './file.sh')을 섞어서 사용해 왔었는데, TOPAS 3.2 patch02를 새로 설치하고 테스트로 rundemos.csh를 실행하면서 별 생각없이 'chmod u+x rundemos.csh'로 실행 가능 파일로 만들어주고 './rundemos.csh'로 실행을 하려고 하니 자꾸 library를 못찾겠다는 오류가 발생하였다. Library path 설정도 정상적으로 잘 되어있는데... 이상하다 싶어서 'source rundemos.csh' 해보니 아무런 문제없이 마지막 한 줄 까지 잘 실행이 되는 것이다. 'source file.sh' 또는 '. ./file.sh'의 경우에는 현재 실행 중인.. 2020. 3. 22.
binary raw file access 프로젝트 손털기 가벼운 대화에서 시작해서 별다른 생각없이 벌였던 프로젝트 - binary raw file access 프로젝트를 2020년 3월 9일부로 일단락지었다. 2018년 3월에 샘플 파일들과 관련 자료들을 받아놓고는 바쁜 업무에 쫓겨 한동안 거의 손을 못대고 있었다. 육아휴직을 시작하고 한동안은 아무런 생각없이 살기를 실천해오다가, 지난 2019년 가을의 시작과 함께 본격적으로 뚝딱~뚝딱~, 2019년을 보내기 전에 마무리를 해야겠다는 목표로 서둘렀으나... 결국에는 연말을 넘겨야 했다. 그리고는 중국 우한발 COVID-19로 시작된 휴교령은 아직도 진행형이라 짬을 내기는 점점 더 어려워지는 형국인지라... 지난 해에 개발 해놓은 상태에서(binary raw file을 불러와서 간단한 image와 paramet.. 2020. 3. 20.
방사선치료와 좌표계 일반적으로 방사선 치료는 환자의 체내에 위치한 종양 세포들에 방사선을 조사해서 종양 세포들이 파괴되도록 합니다. 여기서 두 가지 중요한 이야기를 할 수 있습니다. 눈치채셨겠지만, 두 가지 모두 위치에 관련된 이야기입니다; 첫 번째로, 몸 안 어느 곳에 종양 세포들이 있는지, 즉, 종양 세포들의 위치입니다. 방사선으로 파괴하고자 하는 종양 세포들의 위치와 그 주변에 분포한 정상 조직들 또는 내부 장기들에 대한 정보를 확인하는 것으로 진단 diagnosis 과정에서도 확인하지만, 방사선 치료가 결정된 이후에는, 방사선 종양학과에서 simulation이라는 과정을 거치게 됩니다. 인체 내부의 해부학적인(경우에 따라서는 추가적으로 생리학적인) 정보를 얻기 위해서는 각종 영상장비들을 사용하게 되는데요, CT, M.. 2020. 1. 10.
방사선 종양학과 물리학 방사선 종양학(Radiation Oncology)과 물리학(Physics) 방사선 종양학은 기본적으로 방사선을 이용하여 암을 치료하는 의학의 한 분야입니다. 방사선을 이용한다는 특성 때문에 다른 의학 분야들과는 조금 다르게 물리학 또는 공학(주로 원자력 공학)에 대한 어느 정도 깊이있는 이해를 필요로 합니다. 예를 들자면, 방사성동위원소의 경우 기본적인 원자에 대한 이해가 필요하며, 방사선 치료에 사용되는 장비에서 어떤 방식으로 방사선(X-ray)이 만들어지는 지 알기 위해서 높은 에너지로 가속된 전자(electron)가 원자 번호가 높은 물질과 만나면 어떤 반응을 하는지 알아야하고, 인체 흡수선량을 이해하기 위해서는 광자(photon)가 물질들과 어떤 방식으로 상호작용(interaction)하는 지를 .. 2019. 12. 18.

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