본문 바로가기

의학물리30

FreeSurfer 설치 근래에 Brain MR 영상 데이터 관련 요청을 받게되면서, 이런 게 있다는 사실만 알고 지내던 FreeSurfer 를 직접 설치 및 사용할 계기가 생겨버렸다. 참고로 FreeSurfer 는 뇌신경영상 데이터의 분석과 시각화를 위한 소프트웨어 패키지이고 Laboratory for Computational Neuroimaging at the Athinoula A. Martinos Center for Biomedical Imaging 에서 개발되었다고 한다. 요즘은 인공지능 관련 연구들을 하는 사람들이 더 활발하게 사용하고 있는 것 같기도 하고. 설치를 위해 MacOS 환경에서 현재 가장 최신 stable release 인 7.4.1 버전으로 패키지 파일을 다운로드 받았다(https://surfer.nmr... 2024. 2. 15.
gparted 사용해서 가성머신(리눅스) home 용량 늘리기 Geant4 가상머신을 다운로드 받아 설치하고 사용하다보면 어김없이 디스크가 부족한 상황을 겪게된다. 가상머신 설정에서 디스크 용량을 늘리는 작업에 추가해서 리눅스 내부적으로도 새로이 파티션 작업(?)이 필요하다. 이 때 편리하게 사용할 수 있는 것이 gparted 프로그램이다. 물론 커맨드 라인에서 작업을 할 수도 있지만 아직은 마우스로 스-윽 설정할 수 있는 GUI 프로그램이 편리하다. 하하하. 2023. 12. 13.
TOPAS Time Features TOPAS User guide 에서 발췌 A Time Feature is a set of parameters that ultimately describes the change of a time feature Value. You provide parameters that define the time function, such as a linear change over time. TOPAS automatically creates a Value parameter for this function (a parameter you don’t define). TOPAS continually updates this Value parameter to the appropriate value for a given time. .. 2023. 12. 6.
Streamlit 시작하기 - Day 10 Day 10 은 selectbox 에 대한 소개. 데모는 아래 링크에서 확인 가능! https://dataprofessor-st-selectbox-streamlit-app-ridx2e.streamlit.app/ A faster way to build and share data apps st.selectbox allows the display of a select widget. dataprofessor-st-selectbox-streamlit-app-ridx2e.streamlit.app 2023. 4. 16.
Streamlit 시작하기 - Day 9 Day 9 챌린지는 Line chart. pandas, numpy 를 이용해서 생성한 테이블을 st.line_chart 명령어를 이용해서 아래와 같이 예쁘게 Line chart 로 만들어 줄 수 있다! 2023. 3. 16.
Streamlit 시작하기 - Day 8 Day 8 에는 slider 기능에 대한 안내. 이렇게 간단하게 slider 기능을 구현할 수 있다니! 데모는 아래 링크에서 확인해 볼 수 있다. https://share.streamlit.io/dataprofessor/st.slider/ https://share.streamlit.io/dataprofessor/st.slider/ share.streamlit.io 2023. 3. 10.
Streamlit 시작하기 - Day 7 Day 7 에는 클라우드에 등록하고 깃헙에 연동하라고 한다. Day 6 에 생성한 깃헙 repository 를 시키는 대로 연동해서 deploy 하면 끝. 2023. 3. 8.