FreeSurfer 설치

근래에 Brain MR 영상 데이터 관련 요청을 받게되면서, 이런 게 있다는 사실만 알고 지내던 FreeSurfer 를 직접 설치 및 사용할 계기가 생겨버렸다.

참고로 FreeSurfer 는 뇌신경영상 데이터의 분석과 시각화를 위한 소프트웨어 패키지이고 Laboratory for Computational Neuroimaging at the Athinoula A. Martinos Center for Biomedical Imaging 에서 개발되었다고 한다. 요즘은 인공지능 관련 연구들을 하는 사람들이 더 활발하게 사용하고 있는 것 같기도 하고.

설치를 위해 MacOS 환경에서 현재 가장 최신 stable release 인 7.4.1 버전으로 패키지 파일을 다운로드 받았다(https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/ReleaseNotes). 미리 설치가 되어있는 Virtual Machine 도 준비되어있다고 하니 참고하시라.

그리고 라이센스 파일을 따로 요청해서 받아야한다(https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/registration.html). 링크를 따라가 요청하고 메일로 라이센스 키가 들어있는 텍스트 파일을 받으면 된다.

패키지 파일을 열어서 시키는 대로 설치를 진행하고 확인해보니 파일들은 /Applications/freesurfer/7.4.1/ 에 자리잡고 있다. 설치가 종료되었을 때 알려준 초보용 안내 링크 https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/FreeSurferBeginnersGuide.

일단 설치는 여기까지. Let's keep it on.