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misc./Software

[Python] DICOM 파일 열기

by medical physicist 2023. 2. 17.

의료영상 관련 데이터들은 국제표준인 DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine) 형식을 따른다. DICOM-RT는 방사선종양학과에 특화된 DICOM 의 확장인데 의학물리학자의 임상 업무에서는 깊이 있게 다룰 일이 종종 생기기도 한다. 특히나 요즘과 같이 데이터가 기반이 되는 연구가 유행인 경우에는 더더욱.

DICOM 파일을 다루는 소프트웨어들은 정말 다양하게 많은데, 그 중에서 별도의 구매 비용 없이, 그리고 상대적으로 편리하게 다룰 수 있는 가성비 슈퍼갑은 Python 이라고 해도 무리는 아닐 듯 싶다. Python 에는 DICOM 을 다룰 수 있는 라이브러리, Pydicom 이 있어서 어지간한 작업은 모듈에서 제공하는 기능들을 사용하면 다 해결된다.

import pydicom
ds = pydicom.dcmread('path/to/file')

 

일단 이렇게 하면 열기 성공. 다음에는 파일 안에 들여보기.

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